2005年以来，上海海事法院与上海海事大学签署合作协议，在海事法院设立“海事大学海商法实习基地”，在海事大学成立“亚太地区海事司法中心人才培训基地”，共同培养我国海事法律领域急需的中高级专业人才。 

2007年6月13日下午，双方单位续签合作协议，进一步加强人才培养和应用型法律研究等方面的合作，共同为上海国际航运中心建设和社会经济的和谐发展提供优质服务。